Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZEB1P37275 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZEB1P37275 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms