Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms