Protein–RNA interactions for Protein: P30203

CD6, T-cell differentiation antigen CD6, humanhuman

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD6P30203 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD6P30203 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD6P30203 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD6P30203 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD6P30203 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CD6P30203 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD6P30203 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD6P30203 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD6P30203 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD6P30203 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD6P30203 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD6P30203 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD6P30203 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD6P30203 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD6P30203 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CD6P30203 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD6P30203 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD6P30203 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD6P30203 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD6P30203 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CD6P30203 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD6P30203 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD6P30203 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD6P30203 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD6P30203 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD6P30203 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD6P30203 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD6P30203 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CD6P30203 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD6P30203 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CD6P30203 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD6P30203 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD6P30203 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CD6P30203 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD6P30203 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD6P30203 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD6P30203 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD6P30203 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD6P30203 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD6P30203 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD6P30203 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD6P30203 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CD6P30203 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD6P30203 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD6P30203 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD6P30203 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD6P30203 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD6P30203 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD6P30203 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD6P30203 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD6P30203 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD6P30203 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD6P30203 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CD6P30203 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CD6P30203 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CD6P30203 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD6P30203 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD6P30203 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD6P30203 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD6P30203 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD6P30203 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD6P30203 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CD6P30203 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD6P30203 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CD6P30203 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CD6P30203 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD6P30203 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD6P30203 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD6P30203 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD6P30203 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD6P30203 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD6P30203 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD6P30203 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD6P30203 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD6P30203 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD6P30203 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD6P30203 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD6P30203 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD6P30203 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD6P30203 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD6P30203 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD6P30203 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD6P30203 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD6P30203 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD6P30203 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD6P30203 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD6P30203 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD6P30203 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD6P30203 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD6P30203 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD6P30203 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD6P30203 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD6P30203 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD6P30203 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD6P30203 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD6P30203 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD6P30203 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD6P30203 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD6P30203 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD6P30203 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms