Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCAP28676 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCAP28676 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCAP28676 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCAP28676 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCAP28676 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCAP28676 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCAP28676 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCAP28676 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCAP28676 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCAP28676 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCAP28676 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCAP28676 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCAP28676 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCAP28676 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCAP28676 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCAP28676 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCAP28676 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCAP28676 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCAP28676 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCAP28676 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GCAP28676 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GCAP28676 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GCAP28676 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GCAP28676 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GCAP28676 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GCAP28676 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GCAP28676 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GCAP28676 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GCAP28676 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GCAP28676 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GCAP28676 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GCAP28676 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GCAP28676 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GCAP28676 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GCAP28676 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GCAP28676 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GCAP28676 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GCAP28676 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GCAP28676 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GCAP28676 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GCAP28676 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GCAP28676 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GCAP28676 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GCAP28676 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GCAP28676 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GCAP28676 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GCAP28676 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GCAP28676 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GCAP28676 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GCAP28676 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GCAP28676 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GCAP28676 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GCAP28676 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GCAP28676 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GCAP28676 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GCAP28676 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GCAP28676 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GCAP28676 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GCAP28676 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GCAP28676 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GCAP28676 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GCAP28676 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GCAP28676 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GCAP28676 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GCAP28676 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GCAP28676 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCAP28676 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCAP28676 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCAP28676 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCAP28676 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCAP28676 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCAP28676 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCAP28676 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCAP28676 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCAP28676 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCAP28676 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCAP28676 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCAP28676 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCAP28676 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCAP28676 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCAP28676 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GCAP28676 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCAP28676 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCAP28676 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCAP28676 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCAP28676 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCAP28676 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCAP28676 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCAP28676 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCAP28676 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCAP28676 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCAP28676 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GCAP28676 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCAP28676 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCAP28676 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCAP28676 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GCAP28676 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCAP28676 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCAP28676 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms