Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFE3P19532 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFE3P19532 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFE3P19532 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFE3P19532 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFE3P19532 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFE3P19532 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFE3P19532 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFE3P19532 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFE3P19532 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFE3P19532 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFE3P19532 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFE3P19532 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFE3P19532 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TFE3P19532 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFE3P19532 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFE3P19532 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFE3P19532 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFE3P19532 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFE3P19532 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TFE3P19532 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFE3P19532 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFE3P19532 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFE3P19532 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFE3P19532 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFE3P19532 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFE3P19532 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFE3P19532 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFE3P19532 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFE3P19532 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFE3P19532 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFE3P19532 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFE3P19532 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFE3P19532 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFE3P19532 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFE3P19532 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFE3P19532 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFE3P19532 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFE3P19532 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFE3P19532 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFE3P19532 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TFE3P19532 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFE3P19532 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFE3P19532 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TFE3P19532 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFE3P19532 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFE3P19532 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFE3P19532 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFE3P19532 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFE3P19532 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFE3P19532 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFE3P19532 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFE3P19532 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFE3P19532 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFE3P19532 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFE3P19532 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFE3P19532 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFE3P19532 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFE3P19532 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFE3P19532 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFE3P19532 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFE3P19532 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TFE3P19532 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFE3P19532 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFE3P19532 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFE3P19532 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFE3P19532 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFE3P19532 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFE3P19532 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFE3P19532 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFE3P19532 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFE3P19532 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFE3P19532 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFE3P19532 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFE3P19532 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFE3P19532 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFE3P19532 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFE3P19532 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFE3P19532 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFE3P19532 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFE3P19532 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFE3P19532 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFE3P19532 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TFE3P19532 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TFE3P19532 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFE3P19532 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFE3P19532 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFE3P19532 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFE3P19532 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFE3P19532 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFE3P19532 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFE3P19532 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFE3P19532 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFE3P19532 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFE3P19532 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFE3P19532 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFE3P19532 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFE3P19532 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFE3P19532 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TFE3P19532 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms