Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EGFRP00533 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
EGFRP00533 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EGFRP00533 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EGFRP00533 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EGFRP00533 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EGFRP00533 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EGFRP00533 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EGFRP00533 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EGFRP00533 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EGFRP00533 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EGFRP00533 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EGFRP00533 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EGFRP00533 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EGFRP00533 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EGFRP00533 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EGFRP00533 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EGFRP00533 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EGFRP00533 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EGFRP00533 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EGFRP00533 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EGFRP00533 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EGFRP00533 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EGFRP00533 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EGFRP00533 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EGFRP00533 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
EGFRP00533 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
EGFRP00533 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
EGFRP00533 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EGFRP00533 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
EGFRP00533 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EGFRP00533 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EGFRP00533 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EGFRP00533 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EGFRP00533 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EGFRP00533 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EGFRP00533 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EGFRP00533 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EGFRP00533 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EGFRP00533 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EGFRP00533 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EGFRP00533 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EGFRP00533 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EGFRP00533 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EGFRP00533 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EGFRP00533 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EGFRP00533 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EGFRP00533 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGFRP00533 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGFRP00533 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGFRP00533 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGFRP00533 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGFRP00533 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGFRP00533 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGFRP00533 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGFRP00533 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGFRP00533 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGFRP00533 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGFRP00533 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGFRP00533 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGFRP00533 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGFRP00533 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGFRP00533 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGFRP00533 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGFRP00533 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGFRP00533 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGFRP00533 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGFRP00533 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
EGFRP00533 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGFRP00533 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGFRP00533 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGFRP00533 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGFRP00533 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
EGFRP00533 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGFRP00533 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGFRP00533 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGFRP00533 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGFRP00533 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGFRP00533 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGFRP00533 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGFRP00533 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGFRP00533 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
EGFRP00533 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGFRP00533 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
EGFRP00533 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
EGFRP00533 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGFRP00533 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGFRP00533 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGFRP00533 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGFRP00533 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGFRP00533 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGFRP00533 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGFRP00533 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGFRP00533 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGFRP00533 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGFRP00533 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGFRP00533 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EGFRP00533 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EGFRP00533 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EGFRP00533 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms