Protein–RNA interactions for Protein: O94889

KLHL18, Kelch-like protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL18O94889 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL18O94889 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms