Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTDSP2O14595 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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