Protein–RNA interactions for Protein: C9JVG2

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9JVG2 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9JVG2 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9JVG2 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9JVG2 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9JVG2 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C9JVG2 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9JVG2 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9JVG2 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9JVG2 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C9JVG2 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9JVG2 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9JVG2 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9JVG2 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9JVG2 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C9JVG2 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C9JVG2 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9JVG2 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9JVG2 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9JVG2 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9JVG2 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9JVG2 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C9JVG2 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9JVG2 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9JVG2 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9JVG2 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9JVG2 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9JVG2 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9JVG2 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9JVG2 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9JVG2 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9JVG2 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9JVG2 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9JVG2 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9JVG2 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9JVG2 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9JVG2 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9JVG2 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9JVG2 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9JVG2 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9JVG2 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9JVG2 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9JVG2 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C9JVG2 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9JVG2 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9JVG2 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9JVG2 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9JVG2 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9JVG2 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9JVG2 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C9JVG2 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9JVG2 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9JVG2 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9JVG2 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9JVG2 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9JVG2 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9JVG2 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C9JVG2 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9JVG2 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C9JVG2 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9JVG2 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9JVG2 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9JVG2 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9JVG2 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9JVG2 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C9JVG2 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9JVG2 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9JVG2 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9JVG2 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9JVG2 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9JVG2 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9JVG2 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9JVG2 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9JVG2 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9JVG2 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9JVG2 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9JVG2 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9JVG2 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9JVG2 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9JVG2 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9JVG2 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9JVG2 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9JVG2 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9JVG2 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9JVG2 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9JVG2 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9JVG2 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9JVG2 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9JVG2 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9JVG2 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9JVG2 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9JVG2 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9JVG2 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9JVG2 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9JVG2 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9JVG2 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9JVG2 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9JVG2 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9JVG2 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9JVG2 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9JVG2 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms