Protein–RNA interactions for Protein: A6NHY6

C9orf118, Putative uncharacterized protein C9orf118, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf118A6NHY6 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 TBC1D26-201ENST00000437605 1868 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 SLC1A2-208ENST00000606205 1890 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 KRT74-201ENST00000305620 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 C10orf105-202ENST00000441508 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 BTNL8-201ENST00000231229 2229 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 TBX3-201ENST00000257566 4208 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 RANBP17-219ENST00000523189 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 PRPF4-201ENST00000374198 2787 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
C9orf118A6NHY6 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms