Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL33A6NCF5 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms