Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC144AA2RUR9 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms