Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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