Protein–RNA interactions for Protein: Q96DN0

ERP27, Endoplasmic reticulum resident protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERP27Q96DN0 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERP27Q96DN0 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms