Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6V4

C10orf53, UPF0728 protein C10orf53, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf53Q8N6V4 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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C10orf53Q8N6V4 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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C10orf53Q8N6V4 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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C10orf53Q8N6V4 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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C10orf53Q8N6V4 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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C10orf53Q8N6V4 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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C10orf53Q8N6V4 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C10orf53Q8N6V4 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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