Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC84Q86UT8 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms