Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms