Protein–RNA interactions for Protein: Q6EEV6

SUMO4, Small ubiquitin-related modifier 4, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO4Q6EEV6 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SUMO4Q6EEV6 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms