Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms