Protein–RNA interactions for Protein: Q5JS13

RALGPS1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor RalGPS1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1Q5JS13 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RALGPS1Q5JS13 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RALGPS1Q5JS13 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms