Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI81

KRTAP27-1, Keratin-associated protein 27-1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP27-1Q3LI81 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP27-1Q3LI81 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP27-1Q3LI81 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms