Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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ZIC1Q15915 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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ZIC1Q15915 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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ZIC1Q15915 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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ZIC1Q15915 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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ZIC1Q15915 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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