Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF1AQ15573 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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