Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIX1Q15475 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms