Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFTN1Q14699 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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