Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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