Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms