Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PMS2P11Q13670 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms