Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
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PMS2P3Q13401 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
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PMS2P3Q13401 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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PMS2P3Q13401 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P3Q13401 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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