Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms