Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms