Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms