Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTPAP49638 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTPAP49638 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTPAP49638 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTPAP49638 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTPAP49638 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTPAP49638 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTPAP49638 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTPAP49638 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTPAP49638 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTPAP49638 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTPAP49638 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTPAP49638 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTPAP49638 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTPAP49638 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTPAP49638 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTPAP49638 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTPAP49638 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTPAP49638 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTPAP49638 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTPAP49638 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTPAP49638 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTPAP49638 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTPAP49638 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTPAP49638 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTPAP49638 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTPAP49638 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTPAP49638 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTPAP49638 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTPAP49638 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTPAP49638 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTPAP49638 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTPAP49638 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTPAP49638 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTPAP49638 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTPAP49638 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TTPAP49638 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTPAP49638 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TTPAP49638 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TTPAP49638 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTPAP49638 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTPAP49638 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTPAP49638 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTPAP49638 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTPAP49638 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTPAP49638 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTPAP49638 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTPAP49638 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTPAP49638 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTPAP49638 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTPAP49638 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTPAP49638 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTPAP49638 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTPAP49638 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTPAP49638 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTPAP49638 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTPAP49638 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTPAP49638 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTPAP49638 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTPAP49638 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTPAP49638 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTPAP49638 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTPAP49638 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTPAP49638 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTPAP49638 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TTPAP49638 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTPAP49638 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTPAP49638 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTPAP49638 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTPAP49638 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTPAP49638 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTPAP49638 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTPAP49638 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTPAP49638 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTPAP49638 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTPAP49638 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTPAP49638 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTPAP49638 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTPAP49638 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTPAP49638 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTPAP49638 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTPAP49638 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTPAP49638 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTPAP49638 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTPAP49638 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTPAP49638 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TTPAP49638 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTPAP49638 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTPAP49638 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTPAP49638 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTPAP49638 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTPAP49638 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TTPAP49638 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTPAP49638 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TTPAP49638 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTPAP49638 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTPAP49638 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTPAP49638 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTPAP49638 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTPAP49638 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
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