Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJB2P29033 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GJB2P29033 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GJB2P29033 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GJB2P29033 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GJB2P29033 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GJB2P29033 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GJB2P29033 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GJB2P29033 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GJB2P29033 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GJB2P29033 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GJB2P29033 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJB2P29033 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJB2P29033 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJB2P29033 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJB2P29033 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJB2P29033 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJB2P29033 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJB2P29033 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GJB2P29033 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GJB2P29033 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJB2P29033 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJB2P29033 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GJB2P29033 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJB2P29033 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GJB2P29033 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GJB2P29033 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJB2P29033 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJB2P29033 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJB2P29033 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJB2P29033 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJB2P29033 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJB2P29033 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJB2P29033 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJB2P29033 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB2P29033 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB2P29033 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB2P29033 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB2P29033 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB2P29033 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB2P29033 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB2P29033 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB2P29033 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB2P29033 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB2P29033 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB2P29033 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB2P29033 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB2P29033 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB2P29033 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB2P29033 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB2P29033 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB2P29033 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB2P29033 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB2P29033 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB2P29033 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB2P29033 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB2P29033 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB2P29033 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB2P29033 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB2P29033 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB2P29033 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB2P29033 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB2P29033 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB2P29033 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB2P29033 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB2P29033 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB2P29033 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB2P29033 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB2P29033 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB2P29033 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJB2P29033 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB2P29033 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB2P29033 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB2P29033 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB2P29033 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB2P29033 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB2P29033 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB2P29033 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB2P29033 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB2P29033 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB2P29033 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB2P29033 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB2P29033 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB2P29033 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB2P29033 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB2P29033 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB2P29033 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB2P29033 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB2P29033 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB2P29033 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB2P29033 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB2P29033 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB2P29033 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB2P29033 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB2P29033 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB2P29033 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB2P29033 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB2P29033 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB2P29033 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJB2P29033 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms