Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX7O95931 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX7O95931 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX7O95931 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX7O95931 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX7O95931 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX7O95931 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX7O95931 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX7O95931 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX7O95931 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX7O95931 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CBX7O95931 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CBX7O95931 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CBX7O95931 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CBX7O95931 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
CBX7O95931 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CBX7O95931 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX7O95931 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX7O95931 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX7O95931 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX7O95931 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX7O95931 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX7O95931 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX7O95931 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX7O95931 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CBX7O95931 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX7O95931 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX7O95931 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX7O95931 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX7O95931 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX7O95931 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX7O95931 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX7O95931 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX7O95931 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX7O95931 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX7O95931 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CBX7O95931 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CBX7O95931 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CBX7O95931 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CBX7O95931 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CBX7O95931 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CBX7O95931 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CBX7O95931 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX7O95931 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX7O95931 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX7O95931 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX7O95931 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CBX7O95931 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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