Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.474e-6■■■■■ 101.4
SF3B1O75533 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.141e-6■■■■■ 101.4
SF3B1O75533 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.473e-6■■■■■ 101.4
SF3B1O75533 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.163e-6■■■■■ 101.4
SF3B1O75533 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.743e-6■■■■■ 101.4
SF3B1O75533 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.593e-6■■■■■ 101.4
SF3B1O75533 PCYT2-218ENST00000576343 1006 ntTSL 524.62■■□□□ 1.533e-6■■■■■ 101.4
SF3B1O75533 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.443e-6■■■■■ 101.4
SF3B1O75533 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.333e-6■■■■■ 101.4
SF3B1O75533 HDLBP-204ENST00000391976 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.263e-6■■■■■ 101.4
SF3B1O75533 SMAD5-202ENST00000507118 669 ntTSL 1 (best)25.31■■□□□ 1.642e-7■■■■■ 101.3
SF3B1O75533 SMAD5-207ENST00000511116 847 ntTSL 1 (best)25.31■■□□□ 1.642e-7■■■■■ 101.3
SF3B1O75533 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.545e-6■■■■■ 101.3
SF3B1O75533 SH2B1-208ENST00000563591 588 ntTSL 224.65■■□□□ 1.545e-6■■■■■ 101.3
SF3B1O75533 SH2B1-212ENST00000567536 484 ntTSL 324.46■■□□□ 1.515e-6■■■■■ 101.3
SF3B1O75533 MTA1-214ENST00000494026 852 ntTSL 519.75■□□□□ 0.755e-6■■■■■ 101.3
SF3B1O75533 CD81-204ENST00000468153 940 ntTSL 219.73■□□□□ 0.752e-7■■■■■ 101.3
SF3B1O75533 ZC3H3-202ENST00000528401 546 ntTSL 319.61■□□□□ 0.737e-7■■■■■ 101.3
SF3B1O75533 RFNG-207ENST00000580953 2082 ntTSL 519.57■□□□□ 0.725e-6■■■■■ 101.3
SF3B1O75533 MTA1-216ENST00000498644 871 ntTSL 218.45■□□□□ 0.545e-6■■■■■ 101.3
SF3B1O75533 RFNG-205ENST00000580793 1755 ntTSL 1 (best)18.31■□□□□ 0.525e-6■■■■■ 101.3
SF3B1O75533 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.352e-7■■■■■ 101.3
SF3B1O75533 SMAD5-205ENST00000509297 854 ntTSL 1 (best)17.02■□□□□ 0.322e-7■■■■■ 101.3
SF3B1O75533 RFNG-208ENST00000582478 3107 ntTSL 1 (best)16.75■□□□□ 0.275e-6■■■■■ 101.3
SF3B1O75533 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.255e-7■■■■■ 101.3
SF3B1O75533 SMAD5-206ENST00000509962 547 ntTSL 416.41■□□□□ 0.222e-7■■■■■ 101.3
SF3B1O75533 ST3GAL1-204ENST00000519435 1050 ntTSL 315.68■□□□□ 0.15e-6■■■■■ 101.3
SF3B1O75533 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.058e-6■■■■■ 101.3
SF3B1O75533 RFNG-209ENST00000583784 2886 nt15.23■□□□□ 0.035e-6■■■■■ 101.3
SF3B1O75533 ZNF76-210ENST00000491400 1476 ntTSL 214.35□□□□□ -0.115e-6■■■■■ 101.3
SF3B1O75533 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.28e-6■■■■■ 101.3
SF3B1O75533 SFI1-202ENST00000382162 5250 ntTSL 213.56□□□□□ -0.248e-6■■■■■ 101.3
SF3B1O75533 SMAD5-210ENST00000515005 368 ntTSL 1 (best)13.24□□□□□ -0.292e-7■■■■■ 101.3
SF3B1O75533 ANGEL2-208ENST00000535388 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.325e-6■■■■■ 101.3
SF3B1O75533 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.348e-6■■■■■ 101.3
SF3B1O75533 ZNF83-213ENST00000598536 522 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.375e-6■■■■■ 101.3
SF3B1O75533 SFI1-203ENST00000400288 4002 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.518e-6■■■■■ 101.3
SF3B1O75533 ATP11A-210ENST00000471555 5786 ntTSL 1 (best)11.57□□□□□ -0.565e-6■■■■■ 101.3
SF3B1O75533 ZNF83-218ENST00000601257 704 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.625e-6■■■■■ 101.3
SF3B1O75533 IKBKB-204ENST00000517502 498 ntTSL 310.95□□□□□ -0.665e-6■■■■■ 101.3
SF3B1O75533 SFI1-204ENST00000400289 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.678e-6■■■■■ 101.3
SF3B1O75533 ANGEL2-202ENST00000366962 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.725e-6■■■■■ 101.3
SF3B1O75533 ZNF83-206ENST00000595171 578 ntTSL 49.71□□□□□ -0.865e-6■■■■■ 101.3
SF3B1O75533 ZNF83-219ENST00000602232 575 ntTSL 49.05□□□□□ -0.965e-6■■■■■ 101.3
SF3B1O75533 ZNF83-208ENST00000596440 561 ntTSL 48.24□□□□□ -1.095e-6■■■■■ 101.3
SF3B1O75533 ANGEL2-201ENST00000360506 4323 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.255e-6■■■■■ 101.3
SF3B1O75533 ZNF83-205ENST00000594682 2890 ntTSL 4 BASIC7.18□□□□□ -1.265e-6■■■■■ 101.3
SF3B1O75533 SMAD5-201ENST00000506223 548 ntTSL 46.88□□□□□ -1.312e-7■■■■■ 101.3
SF3B1O75533 ANGEL2-203ENST00000460337 1243 ntTSL 1 (best)4.37□□□□□ -1.715e-6■■■■■ 101.3
SF3B1O75533 ANGEL2-205ENST00000476904 913 ntTSL 34.11□□□□□ -1.755e-6■■■■■ 101.3
SF3B1O75533 ADARB1-207ENST00000460734 2523 ntTSL 1 (best)25.54■■□□□ 1.686e-8■■■■■ 101.2
SF3B1O75533 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.372e-6■■■■■ 101.2
SF3B1O75533 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.62e-6■■■■■ 101.2
SF3B1O75533 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.242e-6■■■■■ 101.2
SF3B1O75533 ZMYND11-205ENST00000381607 3898 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.362e-6■■■■■ 101.2
SF3B1O75533 ZMYND11-203ENST00000381591 4229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.452e-6■■■■■ 101.2
SF3B1O75533 ZMYND11-201ENST00000309776 4228 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.52e-6■■■■■ 101.2
SF3B1O75533 NLRP1-209ENST00000572143 578 ntTSL 411.75□□□□□ -0.532e-6■■■■■ 101.2
SF3B1O75533 NLRP1-213ENST00000576905 555 ntTSL 411.72□□□□□ -0.532e-6■■■■■ 101.2
SF3B1O75533 ZMYND11-207ENST00000397959 4138 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.692e-6■■■■■ 101.2
SF3B1O75533 ADARB1-208ENST00000462214 587 ntTSL 39.18□□□□□ -0.946e-8■■■■■ 101.2
SF3B1O75533 ZMYND11-204ENST00000381604 4066 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.182e-6■■■■■ 101.2
SF3B1O75533 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.52e-6■■■■■ 101.2
SF3B1O75533 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.074e-8■■■■■ 101.2
SF3B1O75533 MFN2-201ENST00000235329 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.424e-8■■■■■ 101.2
SF3B1O75533 SLC25A39-216ENST00000592857 837 ntTSL 323.16■■□□□ 1.35e-7■■■■■ 101.2
SF3B1O75533 SLC25A39-204ENST00000585523 574 ntTSL 421.57■■□□□ 1.045e-7■■■■■ 101.2
SF3B1O75533 SLC25A39-208ENST00000586633 566 ntTSL 319.5■□□□□ 0.715e-7■■■■■ 101.2
SF3B1O75533 SLC25A39-214ENST00000591151 636 ntTSL 215.95■□□□□ 0.145e-7■■■■■ 101.2
SF3B1O75533 PFKFB4-205ENST00000417753 1744 ntTSL 1 (best)24.91■■□□□ 1.582e-6■■■■■ 101.2
SF3B1O75533 PFKFB4-207ENST00000445633 1733 ntTSL 1 (best)24.91■■□□□ 1.582e-6■■■■■ 101.2
SF3B1O75533 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.562e-6■■■■■ 101.2
SF3B1O75533 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.512e-6■■■■■ 101.2
SF3B1O75533 PFKFB4-213ENST00000490115 1757 ntTSL 1 (best)19.69■□□□□ 0.742e-6■■■■■ 101.2
SF3B1O75533 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.012e-6■■■■■ 101.2
SF3B1O75533 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.42e-6■■■■■ 101.1
SF3B1O75533 SEMA7A-204ENST00000567345 674 ntTSL 421.71■■□□□ 1.073e-6■■■■■ 101.1
SF3B1O75533 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.371e-6■■■■■ 101.1
SF3B1O75533 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.446e-6■■■■■ 101.1
SF3B1O75533 QSOX1-202ENST00000367602 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.356e-6■■■■■ 101.1
SF3B1O75533 SPTA1-204ENST00000467387 465 ntTSL 58.27□□□□□ -1.092e-14■■■■■ 101.1
SF3B1O75533 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.732e-6■■■■■ 101.1
SF3B1O75533 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.462e-6■■■■■ 101.1
SF3B1O75533 PRR5-210ENST00000459857 560 ntTSL 421.55■■□□□ 1.041e-6■■■■■ 101
SF3B1O75533 PLEC-213ENST00000528025 2115 ntTSL 519.89■□□□□ 0.773e-6■■■■■ 101
SF3B1O75533 PLEC-215ENST00000532346 316 ntTSL 316.84■□□□□ 0.293e-6■■■■■ 101
SF3B1O75533 DDHD1-203ENST00000395606 12769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.793e-6■■■■■ 101
SF3B1O75533 DDHD1-210ENST00000612692 12339 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.813e-6■■■■■ 101
SF3B1O75533 CDC14A-201ENST00000336454 4137 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.381e-6■■■■■ 100.9
SF3B1O75533 ILF3-221ENST00000591649 2579 ntTSL 214.71□□□□□ -0.056e-8■■■■■ 100.8
SF3B1O75533 ILF3-220ENST00000590869 531 ntTSL 514.07□□□□□ -0.166e-8■■■■■ 100.8
SF3B1O75533 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.683e-6■■■■■ 100.8
SF3B1O75533 ZBTB48-207ENST00000488936 784 ntTSL 315.63■□□□□ 0.093e-6■■■■■ 100.8
SF3B1O75533 RELN-201ENST00000343529 11565 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.73e-7■■■■■ 100.8
SF3B1O75533 RELN-202ENST00000424685 11571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.73e-7■■■■■ 100.8
SF3B1O75533 RELN-203ENST00000428762 11571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.73e-7■■■■■ 100.8
SF3B1O75533 SMYD3-202ENST00000366517 1372 ntTSL 1 (best)8.18□□□□□ -1.12e-6■■■■■ 100.7
SF3B1O75533 PI4KA-215ENST00000485963 2301 ntTSL 224.11■■□□□ 1.453e-6■■■■■ 100.6
SF3B1O75533 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.182e-6■■■■■ 100.6
SF3B1O75533 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.82e-6■■■■■ 100.6
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 1290.1 ms