Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTNSO60931 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTNSO60931 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTNSO60931 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTNSO60931 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTNSO60931 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTNSO60931 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTNSO60931 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTNSO60931 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTNSO60931 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CTNSO60931 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTNSO60931 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CTNSO60931 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTNSO60931 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTNSO60931 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTNSO60931 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CTNSO60931 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTNSO60931 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTNSO60931 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTNSO60931 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CTNSO60931 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTNSO60931 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTNSO60931 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTNSO60931 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTNSO60931 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CTNSO60931 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTNSO60931 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTNSO60931 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTNSO60931 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTNSO60931 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTNSO60931 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNSO60931 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNSO60931 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNSO60931 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNSO60931 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNSO60931 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNSO60931 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNSO60931 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNSO60931 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNSO60931 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNSO60931 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNSO60931 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNSO60931 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNSO60931 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNSO60931 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNSO60931 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNSO60931 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNSO60931 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNSO60931 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNSO60931 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNSO60931 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNSO60931 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNSO60931 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNSO60931 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNSO60931 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNSO60931 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNSO60931 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNSO60931 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNSO60931 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNSO60931 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNSO60931 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNSO60931 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNSO60931 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNSO60931 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNSO60931 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNSO60931 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNSO60931 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNSO60931 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNSO60931 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNSO60931 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNSO60931 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNSO60931 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNSO60931 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNSO60931 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNSO60931 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNSO60931 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNSO60931 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNSO60931 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNSO60931 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNSO60931 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNSO60931 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNSO60931 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNSO60931 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNSO60931 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNSO60931 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNSO60931 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNSO60931 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTNSO60931 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CTNSO60931 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTNSO60931 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTNSO60931 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTNSO60931 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTNSO60931 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTNSO60931 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTNSO60931 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTNSO60931 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTNSO60931 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTNSO60931 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTNSO60931 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTNSO60931 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms