Protein–RNA interactions for Protein: O00507

USP9Y, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YO00507 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP9YO00507 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP9YO00507 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP9YO00507 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP9YO00507 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP9YO00507 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP9YO00507 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
USP9YO00507 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP9YO00507 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP9YO00507 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
USP9YO00507 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP9YO00507 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP9YO00507 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP9YO00507 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
USP9YO00507 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP9YO00507 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP9YO00507 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP9YO00507 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP9YO00507 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP9YO00507 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP9YO00507 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP9YO00507 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP9YO00507 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP9YO00507 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
USP9YO00507 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP9YO00507 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP9YO00507 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP9YO00507 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9YO00507 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9YO00507 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9YO00507 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9YO00507 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9YO00507 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9YO00507 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9YO00507 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9YO00507 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9YO00507 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9YO00507 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9YO00507 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9YO00507 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9YO00507 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9YO00507 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9YO00507 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9YO00507 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9YO00507 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9YO00507 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9YO00507 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9YO00507 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9YO00507 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9YO00507 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9YO00507 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9YO00507 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9YO00507 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9YO00507 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9YO00507 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9YO00507 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9YO00507 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9YO00507 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9YO00507 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9YO00507 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9YO00507 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9YO00507 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9YO00507 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9YO00507 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9YO00507 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9YO00507 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9YO00507 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9YO00507 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9YO00507 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9YO00507 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9YO00507 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9YO00507 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9YO00507 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9YO00507 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
USP9YO00507 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP9YO00507 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP9YO00507 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP9YO00507 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
USP9YO00507 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP9YO00507 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP9YO00507 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP9YO00507 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP9YO00507 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP9YO00507 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP9YO00507 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP9YO00507 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP9YO00507 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP9YO00507 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP9YO00507 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP9YO00507 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
USP9YO00507 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
USP9YO00507 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP9YO00507 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP9YO00507 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP9YO00507 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP9YO00507 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP9YO00507 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP9YO00507 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP9YO00507 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
USP9YO00507 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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