Protein–RNA interactions for Protein: H3BU86

STX16-NPEPL1, STX16-NPEPL1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX16-NPEPL1H3BU86 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
STX16-NPEPL1H3BU86 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
STX16-NPEPL1H3BU86 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
STX16-NPEPL1H3BU86 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
STX16-NPEPL1H3BU86 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
STX16-NPEPL1H3BU86 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
STX16-NPEPL1H3BU86 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
STX16-NPEPL1H3BU86 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
STX16-NPEPL1H3BU86 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
STX16-NPEPL1H3BU86 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
STX16-NPEPL1H3BU86 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
STX16-NPEPL1H3BU86 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
STX16-NPEPL1H3BU86 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
STX16-NPEPL1H3BU86 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
STX16-NPEPL1H3BU86 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
STX16-NPEPL1H3BU86 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
STX16-NPEPL1H3BU86 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
STX16-NPEPL1H3BU86 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
STX16-NPEPL1H3BU86 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
STX16-NPEPL1H3BU86 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
STX16-NPEPL1H3BU86 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
STX16-NPEPL1H3BU86 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
STX16-NPEPL1H3BU86 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
STX16-NPEPL1H3BU86 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
STX16-NPEPL1H3BU86 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
STX16-NPEPL1H3BU86 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
STX16-NPEPL1H3BU86 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
STX16-NPEPL1H3BU86 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
STX16-NPEPL1H3BU86 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
STX16-NPEPL1H3BU86 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
STX16-NPEPL1H3BU86 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
STX16-NPEPL1H3BU86 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
STX16-NPEPL1H3BU86 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
STX16-NPEPL1H3BU86 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
STX16-NPEPL1H3BU86 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
STX16-NPEPL1H3BU86 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
STX16-NPEPL1H3BU86 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
STX16-NPEPL1H3BU86 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
STX16-NPEPL1H3BU86 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
STX16-NPEPL1H3BU86 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
STX16-NPEPL1H3BU86 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
STX16-NPEPL1H3BU86 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
STX16-NPEPL1H3BU86 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
STX16-NPEPL1H3BU86 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
STX16-NPEPL1H3BU86 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
STX16-NPEPL1H3BU86 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
STX16-NPEPL1H3BU86 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms