Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KNCNA6PVL3 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms