Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL33A6NCF5 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms