Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6S9

RPS6KL1, Ribosomal protein S6 kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KL1Q9Y6S9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPS6KL1Q9Y6S9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPS6KL1Q9Y6S9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPS6KL1Q9Y6S9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPS6KL1Q9Y6S9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPS6KL1Q9Y6S9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPS6KL1Q9Y6S9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPS6KL1Q9Y6S9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPS6KL1Q9Y6S9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPS6KL1Q9Y6S9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPS6KL1Q9Y6S9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPS6KL1Q9Y6S9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS6KL1Q9Y6S9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS6KL1Q9Y6S9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS6KL1Q9Y6S9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS6KL1Q9Y6S9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS6KL1Q9Y6S9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS6KL1Q9Y6S9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS6KL1Q9Y6S9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS6KL1Q9Y6S9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS6KL1Q9Y6S9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS6KL1Q9Y6S9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS6KL1Q9Y6S9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS6KL1Q9Y6S9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS6KL1Q9Y6S9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS6KL1Q9Y6S9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS6KL1Q9Y6S9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS6KL1Q9Y6S9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS6KL1Q9Y6S9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS6KL1Q9Y6S9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS6KL1Q9Y6S9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS6KL1Q9Y6S9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS6KL1Q9Y6S9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS6KL1Q9Y6S9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS6KL1Q9Y6S9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS6KL1Q9Y6S9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS6KL1Q9Y6S9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS6KL1Q9Y6S9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS6KL1Q9Y6S9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS6KL1Q9Y6S9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS6KL1Q9Y6S9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS6KL1Q9Y6S9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS6KL1Q9Y6S9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS6KL1Q9Y6S9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS6KL1Q9Y6S9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KL1Q9Y6S9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KL1Q9Y6S9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KL1Q9Y6S9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KL1Q9Y6S9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KL1Q9Y6S9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KL1Q9Y6S9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS6KL1Q9Y6S9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPS6KL1Q9Y6S9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RPS6KL1Q9Y6S9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPS6KL1Q9Y6S9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RPS6KL1Q9Y6S9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RPS6KL1Q9Y6S9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RPS6KL1Q9Y6S9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KL1Q9Y6S9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KL1Q9Y6S9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KL1Q9Y6S9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KL1Q9Y6S9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KL1Q9Y6S9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KL1Q9Y6S9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KL1Q9Y6S9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KL1Q9Y6S9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KL1Q9Y6S9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KL1Q9Y6S9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS6KL1Q9Y6S9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KL1Q9Y6S9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KL1Q9Y6S9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KL1Q9Y6S9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KL1Q9Y6S9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KL1Q9Y6S9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KL1Q9Y6S9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KL1Q9Y6S9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KL1Q9Y6S9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KL1Q9Y6S9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KL1Q9Y6S9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KL1Q9Y6S9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KL1Q9Y6S9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KL1Q9Y6S9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS6KL1Q9Y6S9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS6KL1Q9Y6S9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS6KL1Q9Y6S9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS6KL1Q9Y6S9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS6KL1Q9Y6S9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS6KL1Q9Y6S9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS6KL1Q9Y6S9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS6KL1Q9Y6S9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS6KL1Q9Y6S9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS6KL1Q9Y6S9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS6KL1Q9Y6S9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS6KL1Q9Y6S9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS6KL1Q9Y6S9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS6KL1Q9Y6S9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS6KL1Q9Y6S9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS6KL1Q9Y6S9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS6KL1Q9Y6S9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS6KL1Q9Y6S9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms