Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y664

KPTN, KICSTOR complex protein kaptin, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPTNQ9Y664 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KPTNQ9Y664 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KPTNQ9Y664 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KPTNQ9Y664 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KPTNQ9Y664 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KPTNQ9Y664 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KPTNQ9Y664 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KPTNQ9Y664 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KPTNQ9Y664 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KPTNQ9Y664 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KPTNQ9Y664 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KPTNQ9Y664 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
KPTNQ9Y664 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KPTNQ9Y664 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KPTNQ9Y664 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KPTNQ9Y664 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KPTNQ9Y664 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KPTNQ9Y664 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KPTNQ9Y664 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KPTNQ9Y664 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KPTNQ9Y664 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KPTNQ9Y664 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KPTNQ9Y664 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KPTNQ9Y664 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KPTNQ9Y664 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KPTNQ9Y664 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KPTNQ9Y664 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KPTNQ9Y664 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
KPTNQ9Y664 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KPTNQ9Y664 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KPTNQ9Y664 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KPTNQ9Y664 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KPTNQ9Y664 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KPTNQ9Y664 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KPTNQ9Y664 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KPTNQ9Y664 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KPTNQ9Y664 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KPTNQ9Y664 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KPTNQ9Y664 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KPTNQ9Y664 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KPTNQ9Y664 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KPTNQ9Y664 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KPTNQ9Y664 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KPTNQ9Y664 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KPTNQ9Y664 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KPTNQ9Y664 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KPTNQ9Y664 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KPTNQ9Y664 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KPTNQ9Y664 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KPTNQ9Y664 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KPTNQ9Y664 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KPTNQ9Y664 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
KPTNQ9Y664 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KPTNQ9Y664 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
KPTNQ9Y664 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KPTNQ9Y664 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KPTNQ9Y664 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KPTNQ9Y664 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KPTNQ9Y664 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KPTNQ9Y664 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KPTNQ9Y664 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KPTNQ9Y664 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KPTNQ9Y664 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KPTNQ9Y664 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KPTNQ9Y664 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KPTNQ9Y664 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KPTNQ9Y664 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KPTNQ9Y664 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KPTNQ9Y664 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KPTNQ9Y664 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
KPTNQ9Y664 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
KPTNQ9Y664 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KPTNQ9Y664 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KPTNQ9Y664 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KPTNQ9Y664 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KPTNQ9Y664 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
KPTNQ9Y664 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KPTNQ9Y664 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KPTNQ9Y664 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KPTNQ9Y664 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KPTNQ9Y664 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KPTNQ9Y664 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
KPTNQ9Y664 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KPTNQ9Y664 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KPTNQ9Y664 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KPTNQ9Y664 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KPTNQ9Y664 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KPTNQ9Y664 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KPTNQ9Y664 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KPTNQ9Y664 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KPTNQ9Y664 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KPTNQ9Y664 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KPTNQ9Y664 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KPTNQ9Y664 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KPTNQ9Y664 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KPTNQ9Y664 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KPTNQ9Y664 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KPTNQ9Y664 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KPTNQ9Y664 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KPTNQ9Y664 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms