Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X3

SNX5, Sorting nexin-5, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX5Q9Y5X3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX5Q9Y5X3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX5Q9Y5X3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX5Q9Y5X3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX5Q9Y5X3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX5Q9Y5X3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SNX5Q9Y5X3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX5Q9Y5X3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX5Q9Y5X3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX5Q9Y5X3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX5Q9Y5X3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX5Q9Y5X3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX5Q9Y5X3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX5Q9Y5X3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX5Q9Y5X3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX5Q9Y5X3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX5Q9Y5X3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX5Q9Y5X3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX5Q9Y5X3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX5Q9Y5X3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX5Q9Y5X3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX5Q9Y5X3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX5Q9Y5X3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX5Q9Y5X3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX5Q9Y5X3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX5Q9Y5X3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX5Q9Y5X3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX5Q9Y5X3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX5Q9Y5X3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX5Q9Y5X3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX5Q9Y5X3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX5Q9Y5X3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX5Q9Y5X3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX5Q9Y5X3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX5Q9Y5X3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX5Q9Y5X3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX5Q9Y5X3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX5Q9Y5X3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX5Q9Y5X3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX5Q9Y5X3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX5Q9Y5X3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX5Q9Y5X3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX5Q9Y5X3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX5Q9Y5X3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX5Q9Y5X3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX5Q9Y5X3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX5Q9Y5X3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX5Q9Y5X3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX5Q9Y5X3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX5Q9Y5X3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX5Q9Y5X3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX5Q9Y5X3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX5Q9Y5X3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX5Q9Y5X3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX5Q9Y5X3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX5Q9Y5X3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX5Q9Y5X3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX5Q9Y5X3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX5Q9Y5X3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX5Q9Y5X3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX5Q9Y5X3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX5Q9Y5X3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX5Q9Y5X3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX5Q9Y5X3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX5Q9Y5X3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX5Q9Y5X3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX5Q9Y5X3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX5Q9Y5X3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX5Q9Y5X3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX5Q9Y5X3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX5Q9Y5X3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX5Q9Y5X3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX5Q9Y5X3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX5Q9Y5X3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX5Q9Y5X3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX5Q9Y5X3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX5Q9Y5X3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX5Q9Y5X3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX5Q9Y5X3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX5Q9Y5X3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX5Q9Y5X3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX5Q9Y5X3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX5Q9Y5X3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX5Q9Y5X3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX5Q9Y5X3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX5Q9Y5X3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX5Q9Y5X3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX5Q9Y5X3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX5Q9Y5X3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX5Q9Y5X3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX5Q9Y5X3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX5Q9Y5X3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX5Q9Y5X3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX5Q9Y5X3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX5Q9Y5X3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX5Q9Y5X3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX5Q9Y5X3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX5Q9Y5X3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX5Q9Y5X3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX5Q9Y5X3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms