Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.56■■■■■ 4.88
DCAF1Q9Y4B6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC45.56■■■■■ 4.88
DCAF1Q9Y4B6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC45.56■■■■■ 4.88
DCAF1Q9Y4B6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC45.56■■■■■ 4.88
DCAF1Q9Y4B6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC45.56■■■■■ 4.88
DCAF1Q9Y4B6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.55■■■■■ 4.88
DCAF1Q9Y4B6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
DCAF1Q9Y4B6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC45.55■■■■■ 4.88
DCAF1Q9Y4B6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC45.55■■■■■ 4.88
DCAF1Q9Y4B6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.54■■■■■ 4.88
DCAF1Q9Y4B6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC45.54■■■■■ 4.88
DCAF1Q9Y4B6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.54■■■■■ 4.88
DCAF1Q9Y4B6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC45.54■■■■■ 4.88
DCAF1Q9Y4B6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.54■■■■■ 4.88
DCAF1Q9Y4B6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC45.53■■■■■ 4.88
DCAF1Q9Y4B6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.53■■■■■ 4.88
DCAF1Q9Y4B6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC45.53■■■■■ 4.88
DCAF1Q9Y4B6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC45.53■■■■■ 4.88
DCAF1Q9Y4B6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.53■■■■■ 4.88
DCAF1Q9Y4B6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
DCAF1Q9Y4B6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
DCAF1Q9Y4B6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC45.52■■■■■ 4.88
DCAF1Q9Y4B6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC45.52■■■■■ 4.88
DCAF1Q9Y4B6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
DCAF1Q9Y4B6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
DCAF1Q9Y4B6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.52■■■■■ 4.88
DCAF1Q9Y4B6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC45.51■■■■■ 4.88
DCAF1Q9Y4B6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.51■■■■■ 4.88
DCAF1Q9Y4B6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC45.51■■■■■ 4.88
DCAF1Q9Y4B6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.5■■■■■ 4.88
DCAF1Q9Y4B6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.5■■■■■ 4.87
DCAF1Q9Y4B6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC45.5■■■■■ 4.87
DCAF1Q9Y4B6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC45.5■■■■■ 4.87
DCAF1Q9Y4B6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.5■■■■■ 4.87
DCAF1Q9Y4B6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.5■■■■■ 4.87
DCAF1Q9Y4B6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
DCAF1Q9Y4B6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
DCAF1Q9Y4B6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC45.49■■■■■ 4.87
DCAF1Q9Y4B6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
DCAF1Q9Y4B6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
DCAF1Q9Y4B6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC45.49■■■■■ 4.87
DCAF1Q9Y4B6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
DCAF1Q9Y4B6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC45.48■■■■■ 4.87
DCAF1Q9Y4B6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC45.48■■■■■ 4.87
DCAF1Q9Y4B6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.47■■■■■ 4.87
DCAF1Q9Y4B6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.47■■■■■ 4.87
DCAF1Q9Y4B6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC45.47■■■■■ 4.87
DCAF1Q9Y4B6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.47■■■■■ 4.87
DCAF1Q9Y4B6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC45.47■■■■■ 4.87
DCAF1Q9Y4B6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC45.47■■■■■ 4.87
DCAF1Q9Y4B6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC45.47■■■■■ 4.87
DCAF1Q9Y4B6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC45.47■■■■■ 4.87
DCAF1Q9Y4B6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC45.47■■■■■ 4.87
DCAF1Q9Y4B6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC45.47■■■■■ 4.87
DCAF1Q9Y4B6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.46■■■■■ 4.87
DCAF1Q9Y4B6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC45.46■■■■■ 4.87
DCAF1Q9Y4B6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC45.45■■■■■ 4.87
DCAF1Q9Y4B6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.45■■■■■ 4.87
DCAF1Q9Y4B6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.44■■■■■ 4.86
DCAF1Q9Y4B6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC45.44■■■■■ 4.86
DCAF1Q9Y4B6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC45.43■■■■■ 4.86
DCAF1Q9Y4B6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
DCAF1Q9Y4B6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.42■■■■■ 4.86
DCAF1Q9Y4B6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.42■■■■■ 4.86
DCAF1Q9Y4B6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC45.42■■■■■ 4.86
DCAF1Q9Y4B6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC45.42■■■■■ 4.86
DCAF1Q9Y4B6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC45.42■■■■■ 4.86
DCAF1Q9Y4B6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.42■■■■■ 4.86
DCAF1Q9Y4B6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.41■■■■■ 4.86
DCAF1Q9Y4B6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC45.41■■■■■ 4.86
DCAF1Q9Y4B6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC45.41■■■■■ 4.86
DCAF1Q9Y4B6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC45.41■■■■■ 4.86
DCAF1Q9Y4B6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC45.4■■■■■ 4.86
DCAF1Q9Y4B6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC45.4■■■■■ 4.86
DCAF1Q9Y4B6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC45.39■■■■■ 4.86
DCAF1Q9Y4B6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.39■■■■■ 4.86
DCAF1Q9Y4B6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.86
DCAF1Q9Y4B6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.37■■■■■ 4.85
DCAF1Q9Y4B6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC45.37■■■■■ 4.85
DCAF1Q9Y4B6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.37■■■■■ 4.85
DCAF1Q9Y4B6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.37■■■■■ 4.85
DCAF1Q9Y4B6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.36■■■■■ 4.85
DCAF1Q9Y4B6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC45.36■■■■■ 4.85
DCAF1Q9Y4B6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC45.36■■■■■ 4.85
DCAF1Q9Y4B6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
DCAF1Q9Y4B6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC45.35■■■■■ 4.85
DCAF1Q9Y4B6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC45.35■■■■■ 4.85
DCAF1Q9Y4B6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC45.35■■■■■ 4.85
DCAF1Q9Y4B6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC45.34■■■■■ 4.85
DCAF1Q9Y4B6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
DCAF1Q9Y4B6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC45.34■■■■■ 4.85
DCAF1Q9Y4B6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC45.33■■■■■ 4.85
DCAF1Q9Y4B6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
DCAF1Q9Y4B6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.85
DCAF1Q9Y4B6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC45.32■■■■■ 4.85
DCAF1Q9Y4B6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC45.32■■■■■ 4.85
DCAF1Q9Y4B6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.85
DCAF1Q9Y4B6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.85
DCAF1Q9Y4B6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC45.32■■■■■ 4.85
DCAF1Q9Y4B6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC45.31■■■■■ 4.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms