Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B5

MTCL1, Microtubule cross-linking factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTCL1Q9Y4B5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MTCL1Q9Y4B5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MTCL1Q9Y4B5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MTCL1Q9Y4B5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MTCL1Q9Y4B5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MTCL1Q9Y4B5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MTCL1Q9Y4B5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MTCL1Q9Y4B5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MTCL1Q9Y4B5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MTCL1Q9Y4B5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MTCL1Q9Y4B5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MTCL1Q9Y4B5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MTCL1Q9Y4B5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTCL1Q9Y4B5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTCL1Q9Y4B5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTCL1Q9Y4B5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTCL1Q9Y4B5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTCL1Q9Y4B5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTCL1Q9Y4B5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTCL1Q9Y4B5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTCL1Q9Y4B5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTCL1Q9Y4B5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTCL1Q9Y4B5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTCL1Q9Y4B5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTCL1Q9Y4B5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTCL1Q9Y4B5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTCL1Q9Y4B5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTCL1Q9Y4B5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTCL1Q9Y4B5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTCL1Q9Y4B5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTCL1Q9Y4B5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTCL1Q9Y4B5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTCL1Q9Y4B5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MTCL1Q9Y4B5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MTCL1Q9Y4B5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MTCL1Q9Y4B5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MTCL1Q9Y4B5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MTCL1Q9Y4B5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MTCL1Q9Y4B5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTCL1Q9Y4B5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTCL1Q9Y4B5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MTCL1Q9Y4B5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MTCL1Q9Y4B5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MTCL1Q9Y4B5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MTCL1Q9Y4B5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MTCL1Q9Y4B5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MTCL1Q9Y4B5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MTCL1Q9Y4B5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MTCL1Q9Y4B5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MTCL1Q9Y4B5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MTCL1Q9Y4B5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MTCL1Q9Y4B5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MTCL1Q9Y4B5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MTCL1Q9Y4B5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MTCL1Q9Y4B5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MTCL1Q9Y4B5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MTCL1Q9Y4B5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MTCL1Q9Y4B5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTCL1Q9Y4B5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTCL1Q9Y4B5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTCL1Q9Y4B5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTCL1Q9Y4B5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTCL1Q9Y4B5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTCL1Q9Y4B5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MTCL1Q9Y4B5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTCL1Q9Y4B5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTCL1Q9Y4B5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTCL1Q9Y4B5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTCL1Q9Y4B5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTCL1Q9Y4B5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTCL1Q9Y4B5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTCL1Q9Y4B5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTCL1Q9Y4B5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTCL1Q9Y4B5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTCL1Q9Y4B5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MTCL1Q9Y4B5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTCL1Q9Y4B5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTCL1Q9Y4B5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTCL1Q9Y4B5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTCL1Q9Y4B5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTCL1Q9Y4B5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTCL1Q9Y4B5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTCL1Q9Y4B5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTCL1Q9Y4B5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTCL1Q9Y4B5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTCL1Q9Y4B5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTCL1Q9Y4B5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTCL1Q9Y4B5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTCL1Q9Y4B5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTCL1Q9Y4B5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTCL1Q9Y4B5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTCL1Q9Y4B5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTCL1Q9Y4B5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTCL1Q9Y4B5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTCL1Q9Y4B5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTCL1Q9Y4B5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTCL1Q9Y4B5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTCL1Q9Y4B5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTCL1Q9Y4B5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTCL1Q9Y4B5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms