Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KIF3AQ9Y496 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KIF3AQ9Y496 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KIF3AQ9Y496 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
KIF3AQ9Y496 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KIF3AQ9Y496 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KIF3AQ9Y496 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KIF3AQ9Y496 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KIF3AQ9Y496 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KIF3AQ9Y496 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KIF3AQ9Y496 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KIF3AQ9Y496 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
KIF3AQ9Y496 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KIF3AQ9Y496 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KIF3AQ9Y496 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KIF3AQ9Y496 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KIF3AQ9Y496 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KIF3AQ9Y496 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KIF3AQ9Y496 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KIF3AQ9Y496 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KIF3AQ9Y496 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KIF3AQ9Y496 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
KIF3AQ9Y496 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KIF3AQ9Y496 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KIF3AQ9Y496 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KIF3AQ9Y496 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KIF3AQ9Y496 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KIF3AQ9Y496 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KIF3AQ9Y496 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KIF3AQ9Y496 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KIF3AQ9Y496 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KIF3AQ9Y496 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KIF3AQ9Y496 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KIF3AQ9Y496 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KIF3AQ9Y496 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KIF3AQ9Y496 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KIF3AQ9Y496 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KIF3AQ9Y496 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KIF3AQ9Y496 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KIF3AQ9Y496 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KIF3AQ9Y496 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
KIF3AQ9Y496 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KIF3AQ9Y496 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KIF3AQ9Y496 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KIF3AQ9Y496 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KIF3AQ9Y496 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
KIF3AQ9Y496 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
KIF3AQ9Y496 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KIF3AQ9Y496 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KIF3AQ9Y496 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KIF3AQ9Y496 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KIF3AQ9Y496 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KIF3AQ9Y496 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KIF3AQ9Y496 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KIF3AQ9Y496 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KIF3AQ9Y496 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KIF3AQ9Y496 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KIF3AQ9Y496 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
KIF3AQ9Y496 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
KIF3AQ9Y496 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KIF3AQ9Y496 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KIF3AQ9Y496 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KIF3AQ9Y496 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KIF3AQ9Y496 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
KIF3AQ9Y496 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
KIF3AQ9Y496 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
KIF3AQ9Y496 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KIF3AQ9Y496 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KIF3AQ9Y496 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KIF3AQ9Y496 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KIF3AQ9Y496 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KIF3AQ9Y496 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KIF3AQ9Y496 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KIF3AQ9Y496 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
KIF3AQ9Y496 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
KIF3AQ9Y496 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KIF3AQ9Y496 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KIF3AQ9Y496 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KIF3AQ9Y496 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KIF3AQ9Y496 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KIF3AQ9Y496 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KIF3AQ9Y496 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KIF3AQ9Y496 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KIF3AQ9Y496 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KIF3AQ9Y496 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KIF3AQ9Y496 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KIF3AQ9Y496 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KIF3AQ9Y496 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KIF3AQ9Y496 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KIF3AQ9Y496 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KIF3AQ9Y496 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KIF3AQ9Y496 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KIF3AQ9Y496 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KIF3AQ9Y496 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KIF3AQ9Y496 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KIF3AQ9Y496 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KIF3AQ9Y496 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KIF3AQ9Y496 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KIF3AQ9Y496 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KIF3AQ9Y496 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms