Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH3BP1Q9Y3L3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH3BP1Q9Y3L3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH3BP1Q9Y3L3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH3BP1Q9Y3L3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3BP1Q9Y3L3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3BP1Q9Y3L3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3BP1Q9Y3L3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3BP1Q9Y3L3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3BP1Q9Y3L3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3BP1Q9Y3L3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3BP1Q9Y3L3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3BP1Q9Y3L3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3BP1Q9Y3L3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3BP1Q9Y3L3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3BP1Q9Y3L3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3BP1Q9Y3L3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3BP1Q9Y3L3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3BP1Q9Y3L3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3BP1Q9Y3L3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3BP1Q9Y3L3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3BP1Q9Y3L3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3BP1Q9Y3L3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3BP1Q9Y3L3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3BP1Q9Y3L3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3BP1Q9Y3L3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3BP1Q9Y3L3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3BP1Q9Y3L3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3BP1Q9Y3L3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3BP1Q9Y3L3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3BP1Q9Y3L3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH3BP1Q9Y3L3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH3BP1Q9Y3L3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH3BP1Q9Y3L3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH3BP1Q9Y3L3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH3BP1Q9Y3L3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH3BP1Q9Y3L3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH3BP1Q9Y3L3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SH3BP1Q9Y3L3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH3BP1Q9Y3L3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH3BP1Q9Y3L3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SH3BP1Q9Y3L3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH3BP1Q9Y3L3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SH3BP1Q9Y3L3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH3BP1Q9Y3L3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH3BP1Q9Y3L3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH3BP1Q9Y3L3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH3BP1Q9Y3L3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH3BP1Q9Y3L3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH3BP1Q9Y3L3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH3BP1Q9Y3L3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH3BP1Q9Y3L3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3BP1Q9Y3L3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SH3BP1Q9Y3L3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3BP1Q9Y3L3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3BP1Q9Y3L3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3BP1Q9Y3L3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3BP1Q9Y3L3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3BP1Q9Y3L3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3BP1Q9Y3L3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3BP1Q9Y3L3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3BP1Q9Y3L3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3BP1Q9Y3L3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3BP1Q9Y3L3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3BP1Q9Y3L3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3BP1Q9Y3L3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3BP1Q9Y3L3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3BP1Q9Y3L3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3BP1Q9Y3L3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3BP1Q9Y3L3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3BP1Q9Y3L3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SH3BP1Q9Y3L3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3BP1Q9Y3L3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3BP1Q9Y3L3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3BP1Q9Y3L3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3BP1Q9Y3L3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3BP1Q9Y3L3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3BP1Q9Y3L3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3BP1Q9Y3L3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3BP1Q9Y3L3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3BP1Q9Y3L3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3BP1Q9Y3L3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3BP1Q9Y3L3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3BP1Q9Y3L3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms