Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y366

IFT52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT52Q9Y366 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFT52Q9Y366 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFT52Q9Y366 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFT52Q9Y366 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFT52Q9Y366 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFT52Q9Y366 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFT52Q9Y366 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFT52Q9Y366 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFT52Q9Y366 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFT52Q9Y366 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFT52Q9Y366 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFT52Q9Y366 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFT52Q9Y366 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFT52Q9Y366 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFT52Q9Y366 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFT52Q9Y366 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFT52Q9Y366 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFT52Q9Y366 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFT52Q9Y366 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFT52Q9Y366 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFT52Q9Y366 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFT52Q9Y366 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFT52Q9Y366 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFT52Q9Y366 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFT52Q9Y366 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFT52Q9Y366 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFT52Q9Y366 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFT52Q9Y366 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFT52Q9Y366 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFT52Q9Y366 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IFT52Q9Y366 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IFT52Q9Y366 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
IFT52Q9Y366 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IFT52Q9Y366 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
IFT52Q9Y366 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IFT52Q9Y366 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IFT52Q9Y366 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IFT52Q9Y366 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IFT52Q9Y366 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IFT52Q9Y366 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IFT52Q9Y366 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFT52Q9Y366 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFT52Q9Y366 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFT52Q9Y366 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFT52Q9Y366 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IFT52Q9Y366 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IFT52Q9Y366 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IFT52Q9Y366 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IFT52Q9Y366 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IFT52Q9Y366 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IFT52Q9Y366 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IFT52Q9Y366 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IFT52Q9Y366 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IFT52Q9Y366 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IFT52Q9Y366 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFT52Q9Y366 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFT52Q9Y366 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFT52Q9Y366 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFT52Q9Y366 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFT52Q9Y366 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFT52Q9Y366 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFT52Q9Y366 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFT52Q9Y366 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFT52Q9Y366 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFT52Q9Y366 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFT52Q9Y366 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFT52Q9Y366 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFT52Q9Y366 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFT52Q9Y366 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFT52Q9Y366 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFT52Q9Y366 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFT52Q9Y366 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFT52Q9Y366 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFT52Q9Y366 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFT52Q9Y366 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFT52Q9Y366 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFT52Q9Y366 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFT52Q9Y366 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFT52Q9Y366 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFT52Q9Y366 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
IFT52Q9Y366 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFT52Q9Y366 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFT52Q9Y366 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFT52Q9Y366 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFT52Q9Y366 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFT52Q9Y366 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFT52Q9Y366 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFT52Q9Y366 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFT52Q9Y366 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFT52Q9Y366 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFT52Q9Y366 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFT52Q9Y366 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFT52Q9Y366 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFT52Q9Y366 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFT52Q9Y366 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFT52Q9Y366 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFT52Q9Y366 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
IFT52Q9Y366 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
IFT52Q9Y366 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFT52Q9Y366 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms