Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMC3Q9UQE7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMC3Q9UQE7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMC3Q9UQE7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMC3Q9UQE7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMC3Q9UQE7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMC3Q9UQE7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMC3Q9UQE7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMC3Q9UQE7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMC3Q9UQE7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMC3Q9UQE7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMC3Q9UQE7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMC3Q9UQE7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMC3Q9UQE7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SMC3Q9UQE7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMC3Q9UQE7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMC3Q9UQE7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMC3Q9UQE7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMC3Q9UQE7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMC3Q9UQE7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SMC3Q9UQE7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMC3Q9UQE7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMC3Q9UQE7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMC3Q9UQE7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMC3Q9UQE7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMC3Q9UQE7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMC3Q9UQE7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMC3Q9UQE7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMC3Q9UQE7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMC3Q9UQE7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMC3Q9UQE7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMC3Q9UQE7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMC3Q9UQE7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMC3Q9UQE7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMC3Q9UQE7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMC3Q9UQE7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMC3Q9UQE7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMC3Q9UQE7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMC3Q9UQE7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMC3Q9UQE7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMC3Q9UQE7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMC3Q9UQE7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMC3Q9UQE7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMC3Q9UQE7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMC3Q9UQE7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMC3Q9UQE7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMC3Q9UQE7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMC3Q9UQE7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMC3Q9UQE7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMC3Q9UQE7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMC3Q9UQE7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMC3Q9UQE7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMC3Q9UQE7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMC3Q9UQE7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMC3Q9UQE7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMC3Q9UQE7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMC3Q9UQE7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMC3Q9UQE7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SMC3Q9UQE7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMC3Q9UQE7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMC3Q9UQE7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SMC3Q9UQE7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMC3Q9UQE7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMC3Q9UQE7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMC3Q9UQE7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMC3Q9UQE7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMC3Q9UQE7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMC3Q9UQE7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMC3Q9UQE7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMC3Q9UQE7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMC3Q9UQE7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMC3Q9UQE7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMC3Q9UQE7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMC3Q9UQE7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMC3Q9UQE7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMC3Q9UQE7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMC3Q9UQE7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMC3Q9UQE7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMC3Q9UQE7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMC3Q9UQE7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMC3Q9UQE7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMC3Q9UQE7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMC3Q9UQE7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMC3Q9UQE7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMC3Q9UQE7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMC3Q9UQE7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMC3Q9UQE7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMC3Q9UQE7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMC3Q9UQE7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMC3Q9UQE7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMC3Q9UQE7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMC3Q9UQE7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMC3Q9UQE7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMC3Q9UQE7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMC3Q9UQE7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMC3Q9UQE7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMC3Q9UQE7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMC3Q9UQE7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMC3Q9UQE7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMC3Q9UQE7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms